Aha.
Už si to nepamatuji
Problém může být, když se jednotlivé modifikace vzájemně přepisují v těch vytvořených adresářích. Tomu by měl manažer snad(?) zabránit.
Mám třeba hi-res textury a část z nich přepsala česká modifikace (třeba české verze domovních štítů či rozcestníků). Časem dojde k aktualizaci "velké" originální modifikace a ta by zase přepsala mj. i ty české štíty. Pokud manažer zabezpečí správné pořadí načítání modifikací a balíčků, nemůže k přepsání ve hře nikdy dojít, protože "české štíty" se načtou později.
Takto to i ve hře funguje při řazení esm/esp; je potřeba zvažovat, co po čem načítat (klasika: nejprve oficiální Skyrim patch, pak unofficial update, opravující chyby).