Není to normální. Takového problému bych se bál, protože mám Skyrim prolezlý modama a reinstalace by byla pěkně otravná..

Každopádně: ověření instalace na Steamu ji obnoví do původního stavu (s DLS), to by mohlo zabrat.
Můžeš také (máš-li) zakázat v data files všechny addony, zkoušet hru, postupně je přidávat, třeba ti to takto najde haprující přídavek.

Doporučuji nainstalovat všechny unofficial patche (na hru, všechny DLC a HD textury), nemáš-li. Opravují spoustu chyb, možná to bude stačit.