Cosi se mi vybavuje, že na vině by mohla být cesta k zálohám (už si fakt nepamatuju, ale někdy to někde, někdo řešil...)
Já mám odzkoušeno
F:\HRY\Steam\Backups
a bez problémů.
Údajně ale stačí někam zkopírovat adresář SteamApps a po přeinstalaci OS, přesunout zpět (nezkoušeno, nevím)